L'inventaire des archives de l'Eglise nationale protestante de Genève (1542-1944) est accessible sur Adhémar, la base de données des Archives d'Etat.
Les Archives de l'Eglise nationale protestante avaient été déposées aux Archives d'Etat en 1937. Sous le titre général du fonds de l'Eglise nationale protestante, on décrit en réalité trois sous-fonds constitués par le Consistoire (1542-1929), la Compagnie des pasteurs (1546-1944) et la Chambre des prosélytes (1708-1798). A l'occasion de la révision et de la saisie de cet inventaire, une notice historique sur chacune de ces instances a été rédigée.
Ces archives sont fondamentales pour la connaissance des origines du protestantisme et du rôle de Calvin et constituent une source incontournable pour l’étude de l’histoire de Genève, notamment dans sa dimension morale et sociale grâce aux archives du Consistoire.